MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp9

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017399	TTAAA	2	10	11	20	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017399	TA	3	6	51	56	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017399	A	6	6	63	68	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017399	A	7	7	82	88	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017399	AT	4	8	115	122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017399	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017399	GTAA	2	8	2475	2482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017399	T	7	7	2537	2543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017399	ATAAAT	2	12	2570	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017399	GTA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017399	TAC	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017399	TAA	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017399	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017399	T	6	6	2725	2730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017399	A	6	6	2733	2738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017399	TA	3	6	2760	2765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017399	TA	4	8	2768	2775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017399	A	6	6	2778	2783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017399	AAAT	2	8	3722	3729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017399	ATT	2	6	3758	3763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017399	TA	3	6	3791	3796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017399	CTAT	2	8	3800	3807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017399	ATT	2	6	3827	3832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017399	TAT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017399	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017399	TTG	2	6	4485	4490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017399	ATT	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017399	T	6	6	4863	4868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017399	ATA	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017399	A	6	6	4917	4922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017399	ATTTT	2	10	4928	4937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017399	A	6	6	4958	4963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017399	AT	3	6	5004	5009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017399	T	8	8	5039	5046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017399	AATTT	2	10	5066	5075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017399	TAA	2	6	5138	5143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017399	TTC	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017399	TAA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017399	TAG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017399	T	6	6	5228	5233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017399	ACT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017399	T	7	7	5400	5406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017399	AAC	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017399	AT	3	6	5452	5457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017399	TAAA	2	8	5468	5475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017399	A	8	8	5473	5480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017399	TAAA	2	8	5495	5502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017399	ACT	3	9	5517	5525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017399	TAT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017399	TTTA	2	8	5582	5589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017399	AGG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017399	ATT	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017399	TAT	2	6	5942	5947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017399	T	6	6	5961	5966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017399	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017399	CTC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017399	A	6	6	6078	6083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017399	A	7	7	6090	6096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017399	AT	3	6	6107	6112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017399	T	6	6	6120	6125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017399	TGT	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017399	ATT	2	6	6216	6221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017399	ATT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017399	TTTG	2	8	6255	6262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017399	ATTT	2	8	7159	7166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017399	T	6	6	8532	8537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017399	TA	4	8	8540	8547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017399	AT	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017399	T	6	6	8577	8582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017399	A	6	6	8585	8590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017399	T	6	6	8591	8596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017399	AAT	2	6	8684	8689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017399	ATT	2	6	8695	8700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.